RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 PIGSQ96S52 555 aa22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 CLEC1BQ9P126 229 aa22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.37■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.37■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.37■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 FBXL6Q8N531 539 aa22.37■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 CSPG5O95196 566 aa22.36■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 ITGB1P05556 798 aa22.36■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 DNAJB1P25685 340 aa22.36■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.36■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.36■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 TCF15Q12870 199 aa22.35■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 PPFIA1Q13136 1202 aa22.35■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.35■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.35■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.35■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 SQORQ9Y6N5 450 aa22.35■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 LAMA4Q16363 1823 aa22.35■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 SP4Q02446 784 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 GRM4Q14833 912 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 NLRX1Q86UT6 975 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.34■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 CYTH3O43739 400 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 STAG3L1P0CL83 205 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 NRIP1P48552 1158 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 GRIK4Q16099 956 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 POF1BQ8WVV4 589 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
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LTB-210ENST00000429299 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.33■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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LTB-210ENST00000429299 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.32■■□□□ 1.16
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LTB-210ENST00000429299 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.31■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 CDHR1Q96JP9 859 aa22.31■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.31■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.3■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.3■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 GLP2RO95838 553 aa22.3■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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LTB-210ENST00000429299 SKAP1Q86WV1 359 aa22.3■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.3■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 GLG1Q92896 1179 aa22.3■■□□□ 1.16
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LTB-210ENST00000429299 TLE6Q9H808 572 aa22.3■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 FSD2A1L4K1 749 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 PIK3CDO00329 1044 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 GFRA3O60609 400 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 ATP9AO75110 1047 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 TROAPQ12815 778 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.29■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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LTB-210ENST00000429299 ERICH2A1L162 156 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 KCNA2P16389 499 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 CHMLP26374 656 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 MARK3P27448 753 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 AVPR2P30518 371 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 UBE3AQ05086 875 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LTB-210ENST00000429299 ASIC4Q96FT7 647 aa22.28■■□□□ 1.16
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