RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SGO2Q562F6 1265 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 GLG1Q92896 1179 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 PBKQ96KB5 322 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 BTDP43251 543 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 ECE1P42892 770 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRM-202ENST00000400053 ODR4Q5SWX8 454 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TTC25Q96NG3 672 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.55□□□□□ -0.88
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