RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 PHKA2P46019 1235 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ACAD9Q9H845 621 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.25■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CDC25AP30304 524 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ARPP19P56211 112 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 TNFAIP2Q03169 654 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CEP95Q96GE4 821 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 STK36Q9NRP7 1315 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 FCER1AP12319 257 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 OSTNP61366 133 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.153e-7■■■■□ 23.5
NCKAP1-201ENST00000360982 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.24■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MXD3Q9BW11 206 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 GCNT4Q9P109 453 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 GYS2P54840 703 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 DONSONQ9NYP3 566 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 USP17L15C9J2P7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 USP17L11C9JVI0 530 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 USP17L18D6R9N7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 USP17L22D6RA61 530 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 USP17L19D6RCP7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 USP17L20D6RJB6 530 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CASP14P31944 242 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 STAT3P40763 770 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 PEX3P56589 373 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 USP17L24Q0WX57 530 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 PRELPP51888 382 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SEPT6Q14141 434 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 LRRN2O75325 713 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 DDIT3P35638 169 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 KAZNQ674X7 775 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 RFX6Q8HWS3 928 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 THAP9Q9H5L6 903 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 NBPF26B4DH59 902 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 STX2P32856 288 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 NBPF15Q8N660 670 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM170AA1A519 330 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SNAP25P60880 206 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 TTC1Q99614 292 aa22.22■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 EHHADHQ08426 723 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ASB14A6NK59 587 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM196BA6NMK8 535 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 ARHGAP4P98171 946 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 E2F5Q15329 346 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CLDN3O15551 220 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 NFKBIAP25963 317 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 RASSF7Q02833 373 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 GRM4Q14833 912 aa22.2■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 BARGINQ6ZT62 677 aa22.2■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.2■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.2■■□□□ 1.15
NCKAP1-201ENST00000360982 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1-201ENST00000360982 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.2■■□□□ 1.14
NCKAP1-201ENST00000360982 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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