RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304954.3

CSN3-201, Transcript of casein kappa, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN3, Length 836 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3-201ENST00000304954 FAM83GA6ND36 823 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 FOXP2O15409 715 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KRT37O76014 449 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 LTFP02788 710 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 CHGBP05060 677 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 C8BP07358 591 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ATF2P15336 505 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 STAT5AP42229 794 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KIF11P52732 1056 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 NFKB2Q00653 900 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 RGL3Q3MIN7 710 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 WDR48Q8TAF3 677 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 CD320Q9NPF0 282 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.71□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 MAFGO15525 162 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ULK1O75385 1050 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 NCKAP1LP55160 1127 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KCNA10Q16322 511 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 CD276Q5ZPR3 534 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 FAM129CQ86XR2 697 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 CALML6Q8TD86 181 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KCNK12Q9HB15 430 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 OXSMQ9NWU1 459 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KCTD3Q9Y597 815 aa6.7□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ACOT7O00154 380 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 C1QTNF9P0C862 333 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 BPIP17213 487 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 AOAHP28039 575 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 EPHA7Q15375 998 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 PTPROQ16827 1216 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 GPR158Q5T848 1215 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 CPZQ66K79 652 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 TOX2Q96NM4 488 aa6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ZNF839A8K0R7 811 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KCNK3O14649 394 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 FBXO21O94952 628 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 FKBP9O95302 570 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 PTGS1P23219 599 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 CD40P25942 277 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 LSP1P33241 339 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 MC3RP41968 323 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ITGA1P56199 1179 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 LINC00310P59036 64 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 PHC1P78364 1004 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 LRRC32Q14392 662 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 NXPE1Q8N323 547 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 DTX3Q8N9I9 347 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 HIPK4Q8NE63 616 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 GBP4Q96PP9 640 aa6.68□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 HTRA3P83110 453 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 PFKPQ01813 784 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 STRN3Q13033 797 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ATL2Q8NHH9 583 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 PWWP2AQ96N64 755 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 INCENPQ9NQS7 918 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 NTMQ9P121 344 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.67□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 RAB11FIP3O75154 756 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 KRT1P04264 644 aa6.66□□□□□ -1.34
CSN3-201ENST00000304954 PI3P19957 117 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms