RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PQC6 194 aa18.61■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 PPP2R5EQ16537 467 aa18.61■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP44Q17R89 818 aa18.61■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.61■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 ARMC9Q7Z3E5 817 aa18.61■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 FAM133AQ8N9E0 248 aa18.61■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 PPFIBP2Q8ND30 876 aa18.61■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 AKAP12Q02952 1782 aa18.61■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 STX2P32856 288 aa18.6■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.6■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 SNX12Q9UMY4 172 aa18.6■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.6■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 ASNSP08243 561 aa18.6■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 RASA1P20936 1047 aa18.6■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.6■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.59■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 ZNF365Q70YC5 407 aa18.59■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 PPP2R5AQ15172 486 aa18.59■□□□□ 0.57
TRPC1-201ENST00000273482 EXOC3L4Q17RC7 722 aa18.59■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.58■□□□□ 0.57
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TRPC1-201ENST00000273482 QRICH1Q2TAL8 776 aa18.58■□□□□ 0.56
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TRPC1-201ENST00000273482 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
TRPC1-201ENST00000273482 GMNCA6NCL1 334 aa18.57■□□□□ 0.56
TRPC1-201ENST00000273482 RCAN1P53805 252 aa18.57■□□□□ 0.56
TRPC1-201ENST00000273482 CLUL1Q15846 466 aa18.57■□□□□ 0.56
TRPC1-201ENST00000273482 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.57■□□□□ 0.56
TRPC1-201ENST00000273482 DPH6Q7L8W6 267 aa18.57■□□□□ 0.56
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL29Q96CT2 875 aa18.57■□□□□ 0.56
TRPC1-201ENST00000273482 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.56■□□□□ 0.56
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