RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 CYP3A4P08684 503 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 NT5C2P49902 561 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SLC12A3P55017 1021 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 IGBP1P78318 339 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 KCNJ12Q14500 433 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MTERF2Q49AM1 385 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GOLGA8IPA6NC78 632 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF18P17022 549 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CYP3A7P24462 503 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CASP14P31944 242 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CIITAP33076 1130 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 UBXN1Q04323 297 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 XKR9Q5GH70 373 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SPATA1Q5VX52 437 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MYO9BQ13459 2157 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 HOXD13P35453 343 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PPATQ06203 517 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM119Q4V9L6 283 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TTI2Q6NXR4 508 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 NLRX1Q86UT6 975 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM143Q96AN5 459 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PSMA7O14818 248 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CNMDO75829 334 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 RHOBTB3O94955 611 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TFRCP02786 760 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 Q4G0T1 1027 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ODR4Q5SWX8 454 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 NLRC4Q9NPP4 1024 aa7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CYP2J2P51589 502 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PEX3P56589 373 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 RBL2Q08999 1139 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ANO5Q75V66 913 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 DAW1Q8N136 415 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC169A6NNP5 214 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SLC5A5Q92911 643 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 P2RX5Q93086 422 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 FAM20AQ96MK3 541 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 MBOAT7Q96N66 472 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 JADE2Q9NQC1 790 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SLC16A4O15374 487 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 GGPS1O95749 300 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PADI6Q6TGC4 694 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 UNC13DQ70J99 1090 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CHP1Q99653 195 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 RLFQ13129 1914 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 IKBKBO14920 756 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 HIP1RO75146 1068 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ERVK-9P63128 1117 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 ERVK-24P63145 666 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TPM4P67936 248 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 PTPROQ16827 1216 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 CEP170P1Q96L14 293 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.29□□□□□ -1.24
CNIH1-201ENST00000216416 TSKSQ9UJT2 592 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms