RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637667.1

CLN6-222, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLN6, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-222ENST00000637667 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 CTSHP09668 335 aa23■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 RCAN1P53805 252 aa23■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 ADAM17P78536 824 aa23■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 ARHGAP4P98171 946 aa23■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 RAD9AQ99638 391 aa23■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 TRANK1O15050 2925 aa23■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 MAFGO15525 162 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 ADCY7P51828 1080 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 SPRED2Q7Z698 418 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 KCNB2Q92953 911 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 NRCAMQ92823 1304 aa22.99■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 STXBP3O00186 592 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 CDC27P30260 824 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 FGD1P98174 961 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 SEPT8Q92599 483 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 ASB2Q96Q27 587 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 BARHL2Q9NY43 387 aa22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 AMHP03971 560 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 CPA1P15085 419 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 PPFIA1Q13136 1202 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 GRB10Q13322 594 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 GLG1Q92896 1179 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 PGBD1Q96JS3 809 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 ANO3Q9BYT9 981 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 PTPRSQ13332 1948 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 SMCO2A6NFE2 343 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 MARK3P27448 753 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 HSPA4P34932 840 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 FAM26DQ5JW98 314 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 KRT40Q6A162 431 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CLN6-222ENST00000637667 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 LINC01553A4QN01 128 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 LPXNO60711 386 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 GRIK4Q16099 956 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.95■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 SREBF1P36956 1147 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 ERVK-21P61565 698 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 APOBRQ0VD83 1088 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 AP3B2Q13367 1082 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 CEP55Q53EZ4 464 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 Q6ZUG5 572 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 RPAINQ86UA6 219 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 TMEM260Q9NX78 707 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 INSL6Q9Y581 213 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 NFASCO94856 1347 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 ARP10275 920 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 BRF1Q92994 677 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 PCYT2Q99447 389 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 SDF4Q9BRK5 362 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 MEIS1O00470 390 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 CHRNA1P02708 482 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 SCG2P13521 617 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN6-222ENST00000637667 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms