RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-233	ENST00000602338	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-233	ENST00000602338	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-233	ENST00000602338	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-233	ENST00000602338	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-233	ENST00000602338	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC3	P53804	2025 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-233	ENST00000602338	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRNA1	P02708	482 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	GJD3	Q8N144	294 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SGSM2	O43147	1006 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP9A	O75110	1047 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	GHR	P10912	638 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	GNAT1	P11488	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNA2	P16389	499 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	MGAT3	Q09327	533 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	APBB2	Q92870	758 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	NRCAM	Q92823	1304 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	DDAH1	O94760	285 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGB5	P18084	799 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	RXRA	P19793	462 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	MARK3	P27448	753 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CTNNB1	P35222	781 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	LPIN1	Q14693	890 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	GRM6	O15303	877 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	LTBR	P36941	435 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	GRIK4	Q16099	956 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2S	Q16763	222 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CUL5	Q93034	780 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	ZP2	Q05996	745 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PRC1	O43663	620 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CSPG5	O95196	566 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF5B	P33176	963 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	HYAL1	Q12794	435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TTLL3-233	ENST00000602338	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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