RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 C5orf42Q9H799 3197 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 POLR2MP0CAP2 368 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM26DQ5JW98 314 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIOO75962 3097 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 B4E1Z4 1266 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ENPP3O14638 875 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 EYA4O95677 639 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 CHRNA1P02708 482 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 LINC00271P0C7V0 271 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 NRIP1P48552 1158 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 NEDD9Q14511 834 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 RSPH3Q86UC2 560 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 HOMER1Q86YM7 354 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 MSLNLQ96KJ4 702 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 METTL7BQ6UX53 244 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 EFHBQ8N7U6 833 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 LOC730098B7Z3J9 87 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 KLRF2D3W0D1 207 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ZBTB5O15062 677 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 SIGLEC14Q08ET2 396 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 RILPL2Q969X0 211 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR20Q99678 358 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 CLEC1BQ9P126 229 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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CAPNS1-205ENST00000588780 NRCAMQ92823 1304 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ITGB1P05556 798 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 GHRHRQ02643 423 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 COASYQ13057 564 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 CAMK1Q14012 370 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 LPIN1Q14693 890 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ZBTB33Q86T24 672 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 P2RX5Q93086 422 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 DGKIO75912 1065 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJB1P25685 340 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 NT5C2P49902 561 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 PDE1AP54750 535 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 VCPP55072 806 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TRAF1Q13077 416 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TAF2Q6P1X5 1199 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 KLHL23Q8NBE8 558 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 POF1BQ8WVV4 589 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 PPFIA3O75145 1194 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 NAALADL2Q58DX5 795 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TLE6Q9H808 572 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 KAT6AQ92794 2004 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 AVPR2P30518 371 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXK2Q01167 660 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 PPFIA1Q13136 1202 aa25.18■■□□□ 1.62
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CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 H0Y858 1186 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 FIBPO43427 364 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAM17P78536 824 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TLR9Q9NR96 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 CDY2AQ9Y6F7 541 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 STAM2O75886 525 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 STAG3L1P0CL83 205 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 MARK3P27448 753 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 ICAM3P32942 547 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXO47Q5MNV8 452 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 PIGSQ96S52 555 aa25.16■■□□□ 1.62
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