RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDCP20941 246 aa23.7■■□□□ 1.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 MFSD10Q14728 455 aa23.7■■□□□ 1.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.7■■□□□ 1.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.7■■□□□ 1.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.7■■□□□ 1.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIT2Q99578 217 aa23.7■■□□□ 1.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 H3BRB1 525 aa23.7■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.7■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.7■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.7■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 HAS3O00219 553 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMD10O75832 226 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYT1P21579 422 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCM7P33993 719 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 HAS1Q92839 578 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCYT2Q99447 389 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR81Q562E7 1941 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHMP2AO43633 222 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATG7O95352 703 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT76Q01546 638 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBR1Q14596 966 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF174Q15697 407 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLG1Q92896 1179 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.68■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 MARCH6O60337 910 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM20AQ96MK3 541 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOX2Q96NM4 488 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP290O15078 2479 aa23.67■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEMFO60524 1076 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 LGR5O75473 907 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAAP100Q0VG06 881 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC38Q5R3I4 469 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 C7orf31Q8N865 590 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAMM50Q9Y512 469 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBX3O15119 743 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 B4GALT4O60513 344 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYN1P17600 705 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 MARK3P27448 753 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAPPC10P48553 1259 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 CALCRLQ16602 461 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 FERMT3Q86UX7 667 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 AZI2Q9H6S1 392 aa23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 EMSYQ7Z589 1322 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 BACH1O14867 736 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD4P01730 458 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLTBP09497 229 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 DISC1Q9NRI5 854 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.65■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 KAT6AQ92794 2004 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR64B1ANS9 1081 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 H0YGN5 161 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAT5BP51692 787 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 VAV3Q9UKW4 847 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.64■■□□□ 1.38
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSAPP07602 524 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 SESTD1Q86VW0 696 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTMR9Q96QG7 549 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF302Q9NR11 478 aa23.63■■□□□ 1.37
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms