RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557215.5

CLMN-208, Transcript of calmin, human

TSL 3

Gene CLMN, Length 515 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLMN-208	ENST00000557215	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215		B4DLN1	442 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	FIBP	O43427	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	NEMF	O60524	1076 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	S1PR4	O95977	384 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	NR3C2	P08235	984 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CYP2B6	P20813	491 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CIITA	P33076	1130 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	RGS2	P41220	211 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CAP1	Q01518	475 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	STXBP2	Q15833	593 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PRR16	Q569H4	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	USP6NL	Q92738	828 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MAML3	Q96JK9	1138 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ASB14	A6NK59	587 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	FAM86B1	E9PN63	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	SLC37A4	O43826	429 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ITGB5	P18084	799 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	EDNRB	P24530	442 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PRKCZ	Q05513	592 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CEP55	Q53EZ4	464 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ZBTB33	Q86T24	672 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	APBA2	Q99767	749 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	LCT	P09848	1927 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ATP9B	O43861	1147 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	STAM2	O75886	525 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	YEATS4	O95619	227 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	BMP15	O95972	392 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	HOXC6	P09630	235 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CYP3A7	P24462	503 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	HOXD10	P28358	340 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	FLT3LG	P49771	235 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	KCNC4	Q03721	635 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MTMR1	Q13613	665 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ARHGEF6	Q15052	776 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	STK38	Q15208	465 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PTPA	Q15257	358 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	CALCRL	Q16602	461 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215		Q4G0T1	1027 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	ARMCX2	Q7L311	632 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	NLRX1	Q86UT6	975 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MBOAT7	Q96N66	472 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MEIS1	O00470	390 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	SPTLC2	O15270	562 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MARCH6	O60337	910 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	GNRH1	P01148	92 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	OR52Z1	P0C646	297 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CLMN-208	ENST00000557215	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63

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