RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 USP11P51784 963 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 EMSYQ7Z589 1322 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 CSF2RAP15509 400 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 CCL23P55773 120 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.371e-7■■■■□ 22.6
NELFE-208ENST00000481121 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 IL27Q8NEV9 243 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.62■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 EPHB4P54760 987 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 ACTR2P61160 394 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 TRIM29Q14134 588 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 PITPNM1O00562 1244 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 KRT2P35908 639 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 FOSBP53539 338 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 BFSP2Q13515 415 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 GLG1Q92896 1179 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 LENG9Q96B70 501 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 UIMC1Q96RL1 719 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 SZT2Q5T011 3432 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 SHHQ15465 462 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 INF2Q27J81 1249 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 CAGE1Q8TC20 777 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 OXER1Q8TDS5 423 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 BACH2Q9BYV9 841 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 AZI2Q9H6S1 392 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 EDIL3O43854 480 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 TDP2O95551 362 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 MARK3P27448 753 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 RETREG2Q8NC44 543 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 SCLYQ96I15 445 aa23.59■■□□□ 1.37
NELFE-208ENST00000481121 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 LGR5O75473 907 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 CCNE2O96020 404 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 MMP1P03956 469 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 HOXC8P31273 242 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 PTK7Q13308 1070 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 HIC1Q14526 733 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 IL23AQ9NPF7 189 aa23.58■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 MSH4O15457 936 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 GNAT1P11488 350 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 KRT40Q6A162 431 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 NEK8Q86SG6 692 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.362e-7■■□□□ 14.2
NELFE-208ENST00000481121 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 ACRP10323 421 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 KRT76Q01546 638 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 NR5A1Q13285 461 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 LETM2Q2VYF4 491 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 Q4G0T1 1027 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 PCYT2Q99447 389 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 SETD4Q9NVD3 440 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 NRCAMQ92823 1304 aa23.56■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 GBF1Q92538 1859 aa23.55■■□□□ 1.36
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NELFE-208ENST00000481121 CYP3A7P24462 503 aa23.55■■□□□ 1.36
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NELFE-208ENST00000481121 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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NELFE-208ENST00000481121 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 TET1Q8NFU7 2136 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 SIP14410 1827 aa23.55■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 BACH1O14867 736 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 TREHO43280 583 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 IQCF3P0C7M6 154 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 RFC2P35250 354 aa23.54■■□□□ 1.36
NELFE-208ENST00000481121 MCM2P49736 904 aa23.54■■□□□ 1.36
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