RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 PJA2O43164 708 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 TLR2O60603 784 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SERPING1P05155 500 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ARID5AQ03989 594 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 AP3B2Q13367 1082 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 GDF11O95390 407 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 AMNQ9BXJ7 453 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 MYH4Q9Y623 1939 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.27e-7■■■■■ 46
IMP4-208ENST00000460766 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN26Q16670 478 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 PODNQ7Z5L7 613 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 MBOAT7Q96N66 472 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 EHD2Q9NZN4 543 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 F5H6K3 240 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 CASP5P51878 434 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 PSMC6P62333 389 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 KLRC3Q07444 240 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ERMNQ8TAM6 284 aa22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 CETN3O15182 167 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 CAPN2P17655 700 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 NR2F2P24468 414 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 PDE6BP35913 854 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 RNF40O75150 1001 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 FBXO11Q86XK2 927 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D5Q92609 795 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 DNM3Q9UQ16 869 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SLC26A4O43511 780 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 PAFAH1B1P43034 410 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 MASTLQ96GX5 879 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 TLR10Q9BXR5 811 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 FAM86B1E9PN63 330 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ITIH3Q06033 890 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 KCNH2Q12809 1159 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 GIT2Q14161 759 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SLC7A5Q01650 507 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 REEP2Q9BRK0 252 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 IDI2Q9BXS1 227 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 NDUFB10O96000 172 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 RPA1P27694 616 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 SFR1Q86XK3 245 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 MMP10P09238 476 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 ACTN2P35609 894 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 DNA2P51530 1060 aa22.52■■□□□ 1.2
IMP4-208ENST00000460766 CYP4A11Q02928 519 aa22.52■■□□□ 1.2
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