RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 BMPR1AP36894 532 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 NDUFV1P49821 464 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 CTC1Q2NKJ3 1217 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 PNMA1Q8ND90 353 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 APBB2Q92870 758 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 EVI5LQ96CN4 794 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 WDFY4Q6ZS81 3184 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM221A6NGB7 291 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 M0R296 226 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 IER5LQ5T953 404 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 PRRX2Q99811 253 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.36■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 CAND2O75155 1236 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 GNAT1P11488 350 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 PCP11498 1178 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.652e-11■■■□□ 17.4
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM67Q6ZTA4 783 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM227BQ96M60 508 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.35■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 TECTAO75443 2155 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 LINC01565O15544 149 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 TBX10O75333 385 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 PKN1Q16512 942 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 IQCA1Q86XH1 822 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 DGKHQ86XP1 1220 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 LGALS2P05162 132 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 AMNQ9BXJ7 453 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 SETD4Q9NVD3 440 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-205ENST00000588780 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.33■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A0D9SFI3 127 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 RGS20O76081 388 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 SP2Q02086 613 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 MYH6P13533 1939 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 TGFB3P10600 412 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 CCND2P30279 289 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 HSD17B4P51659 736 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 PGM5Q15124 567 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM86C1Q9NVL1 165 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 COL4A6Q14031 1691 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 NEDD4P46934 1319 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 GFRA3O60609 400 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP4P98171 946 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 USP26Q9BXU7 913 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ZMYM6O95789 1325 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 KDM4AO75164 1064 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 GHRP10912 638 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAM15Q13444 863 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXL6Q8N531 539 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 IL31RAQ8NI17 732 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF213O14771 459 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 MMP1P03956 469 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXC8P31273 242 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ZXDAP98168 799 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 TCF15Q12870 199 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 PLVAPQ9BX97 442 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-205ENST00000588780 OPLAHO14841 1288 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 SP4Q02446 784 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 GNPTABQ3T906 1256 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM50Q86XT4 487 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-205ENST00000588780 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa25.26■■□□□ 1.63
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