RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 BLOC1S6Q9UL45 172 aa20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ASAP2O43150 1006 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 NPTXRO95502 500 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CNGA1P29973 690 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 GNAQP50148 359 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 USP38Q8NB14 1042 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 F8VZ95 297 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ATP6V1G1O75348 118 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ATL2Q8NHH9 583 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 FGD4Q96M96 766 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MYH6P13533 1939 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CYP27B1O15528 508 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 IMPDH2P12268 514 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 IFNAR1P17181 557 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 WASF1Q92558 559 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 THAP9Q9H5L6 903 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 AKAP12Q02952 1782 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CEP104O60308 925 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 RTN1Q16799 776 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ABTB2Q8N961 1025 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 FBF1Q8TES7 1133 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 KIFAP3Q92845 792 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MYH1P12882 1939 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 FAM170AA1A519 330 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 KLRC1P26715 233 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ARID5AQ03989 594 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 KLC1Q07866 573 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 PREBQ9HCU5 417 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TBX22Q9Y458 520 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 AZI2Q9H6S1 392 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ITGA4P13612 1032 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MCM7P33993 719 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MIIPQ5JXC2 388 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 FITM2Q8N6M3 262 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 APPBP2Q92624 585 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ABCD1P33897 745 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MYBPC3Q14896 1274 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 SEPT2Q15019 361 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 RAB17Q9H0T7 212 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 SNX3O60493 162 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MTA1Q13330 715 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CCNJLQ8IV13 435 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TSKSQ9UJT2 592 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 A0A0G2JS52 829 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 PP2D1A8MPX8 630 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 PSMA7O14818 248 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TTI1O43156 1089 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CREB3O43889 395 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TTI2Q6NXR4 508 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 HPS3Q969F9 1004 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TLCD1Q96CP7 247 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 RHBDL2Q9NX52 303 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 GM2AP17900 193 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 GNAZP19086 355 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 MAGEA8P43361 318 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 BNIP1Q12981 228 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 IL17AQ16552 155 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TMEM237Q96Q45 408 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ATP6V1C1P21283 382 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 PLS1Q14651 629 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.28■□□□□ 0.84
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