RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAI14	Q9P0K7	980 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAK	O14976	1311 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266		F8W031	263 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPAA1	O43292	621 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MBD4	O95243	580 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPP2	Q14168	576 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRIK4	Q16099	956 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZS46	218 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	VPS33B	Q9H267	617 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	INCENP	Q9NQS7	918 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAD50	Q92878	1312 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC27A2	O14975	620 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	AOC2	O75106	756 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP2D6	P10635	497 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	LIG1	P18858	919 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPA4	P34932	840 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRK	P46108	304 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K12	Q12852	859 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOGA3	Q5TF21	947 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TICAM2	Q86XR7	235 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPRASP2	Q96D09	838 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF208	Q9H0X6	261 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAPN10	Q9HC96	672 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DOCK2	Q92608	1830 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIP1	O00291	1037 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	GFRA2	O00451	464 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGA	P02671	866 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP21A2	P08686	494 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPA1	P15085	419 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACAD11	Q709F0	780 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	NIM1K	Q8IY84	436 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO27	Q8NI29	283 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATA32	Q96LK8	384 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24	1e-56	■■■■■ 29.5
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBP1	Q9NZI7	540 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIAF1	O95411	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	LMNB1	P20700	586 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTD	P43251	543 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACNB3	P54284	484 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	RING1	Q06587	406 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFIA	Q12857	509 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	INPP5A	Q14642	412 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALX1	Q15699	326 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	NACC1	Q96RE7	527 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRI	Q9BWK5	157 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24	4e-6	■■□□□ 14
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24

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