RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 TNNI2P48788 182 aa28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 SCNN1DP51172 638 aa28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 PRELPP51888 382 aa28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 LEKR1Q6ZMV7 388 aa28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 COG1Q8WTW3 980 aa28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 BAP1Q92560 729 aa28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 JMJD4Q9H9V9 463 aa28.64■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
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OPN3-204ENST00000469376 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa28.63■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa28.63■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 ZNF185O15231 689 aa28.63■■■□□ 2.17
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OPN3-204ENST00000469376 AKR1B1P15121 316 aa28.63■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 HYIQ5T013 277 aa28.63■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 PDXDC1Q6P996 788 aa28.63■■■□□ 2.17
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OPN3-204ENST00000469376 GPCPD1Q9NPB8 672 aa28.63■■■□□ 2.17
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OPN3-204ENST00000469376 TULP2O00295 520 aa28.62■■■□□ 2.17
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OPN3-204ENST00000469376 CREG2Q8IUH2 290 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 PSME4Q14997 1843 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 CXCL9Q07325 125 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 ZCWPW2Q504Y3 356 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 KCNK18Q7Z418 384 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 ADGRF4Q8IZF3 695 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 NT5C3AQ9H0P0 336 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 HYOU1Q9Y4L1 999 aa28.62■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa28.62■■■□□ 2.17
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OPN3-204ENST00000469376 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
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OPN3-204ENST00000469376 TEKT1Q969V4 418 aa28.61■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC19Q96DA6 116 aa28.61■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 CEP63Q96MT8 703 aa28.61■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 MRIQ9BWK5 157 aa28.61■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa28.61■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 IVLP07476 585 aa28.61■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 CAPN2P17655 700 aa28.61■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
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OPN3-204ENST00000469376 MAGEA1P43355 309 aa28.6■■■□□ 2.17
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OPN3-204ENST00000469376 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.6■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.6■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 MOCS3O95396 460 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 CRKP46108 304 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 C2orf54Q08AI8 447 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 PICALMQ13492 652 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 FAM26FQ5R3K3 315 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 HAS1Q92839 578 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 CEP72Q9P209 647 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 SYF2O95926 243 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.171e-6■■■■□ 21
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OPN3-204ENST00000469376 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 MTMR8Q96EF0 704 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 PANK4Q9NVE7 773 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.59■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 MARCH6O60337 910 aa28.58■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 RNF40O75150 1001 aa28.58■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 OSBPL9Q96SU4 736 aa28.58■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 GMLQ99445 158 aa28.58■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 CRACR2AQ9BSW2 395 aa28.58■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
OPN3-204ENST00000469376 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.57■■■□□ 2.16
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OPN3-204ENST00000469376 LRRC41Q15345 812 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 ECM1Q16610 540 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 SELENOOQ9BVL4 669 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 TSKSQ9UJT2 592 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 FAM184BQ9ULE4 1060 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 PCDHA12Q9UN75 941 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 KCNMA1Q12791 1236 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 TNIP1Q15025 636 aa28.57■■■□□ 2.16
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