RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 DEF6Q9H4E7 631 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 QSER1Q2KHR3 1735 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 AKR1B10O60218 316 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 HLA-DOAP06340 250 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 CYP11B2P19099 503 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 ARID5AQ03989 594 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 PRR16Q569H4 304 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 DNA2P51530 1060 aa17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 CCDC40Q4G0X9 1142 aa17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 FAM86B2P0C5J1 330 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 HSPA1LP34931 641 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.24■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 CATSPER3Q86XQ3 398 aa17.24■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.23■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 MS4A14Q96JA4 679 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 KCTD10Q9H3F6 313 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 SNX12Q9UMY4 172 aa17.23■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 SLC12A3P55017 1021 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 ARHGAP4P98171 946 aa17.23■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 TSG101Q99816 390 aa17.23■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.22■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 ICA1Q05084 483 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 KLRC3Q07444 240 aa17.22■□□□□ 0.35
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NISCH-202ENST00000420808 ETNPPLQ8TBG4 499 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 A0A1W2PRG0 241 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 LCA5LO95447 670 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 PTPROQ16827 1216 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 CRYGNQ8WXF5 182 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-202ENST00000420808 TBC1D5Q92609 795 aa17.21■□□□□ 0.35
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