RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 USP6P35125 1406 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NAPAP54920 295 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 FLOT2Q14254 428 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 UBA5Q9GZZ9 404 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 CYP26B1Q9NR63 512 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 ADCY9O60503 1353 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf96A6NNT2 1141 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 ACADSP16219 412 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 NEK10Q6ZWH5 1172 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 SULF1Q8IWU6 871 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRD-201ENST00000355233 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
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