RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FCER1AP12319 257 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MUTP22033 750 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC12A3P55017 1021 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPATQ06203 517 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR162Q16538 588 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTI2Q6NXR4 508 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DYMQ7RTS9 669 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL31RAQ8NI17 732 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSD17B14Q9BPX1 270 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.4■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BICDL2A1A5D9 508 aa24.39■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.39■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC10BA6NIK2 292 aa24.39■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRMPQ12912 555 aa24.39■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR1I3Q14994 352 aa24.39■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.39■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNM3Q9UQ16 869 aa24.39■■□□□ 1.5
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCNE1P24864 410 aa24.39■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.39■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 P2RX5Q93086 422 aa24.39■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.39■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PYCARDQ9ULZ3 195 aa24.39■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP11B2P19099 503 aa24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PGM5Q15124 567 aa24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPBP1Q86WP2 473 aa24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERO1BQ86YB8 467 aa24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEKT3Q9BXF9 490 aa24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THAP9Q9H5L6 903 aa24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JADE2Q9NQC1 790 aa24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PXMP2Q9NR77 195 aa24.38■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IDEP14735 1019 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NSMFQ6X4W1 530 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RMDN3Q96TC7 470 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COASYQ13057 564 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARID5BQ14865 1188 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCP11X2Q5H9J9 407 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.37■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CXCL11O14625 94 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COBLO75128 1261 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OFD1O75665 1012 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMC6P62333 389 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM47Q96LD4 638 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACAD9Q9H845 621 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PANK4Q9NVE7 773 aa24.36■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLITRK3O94933 977 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EYA4O95677 639 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT31Q15323 416 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPHA7Q15375 998 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARSHQ5FYA8 562 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TREML2Q5T2D2 321 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CENPPQ6IPU0 288 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEK9Q8TD19 979 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HPS3Q969F9 1004 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELP3Q9H9T3 547 aa24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNJ18B7U540 433 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRF6O14896 467 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCZ1BP86790 482 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP4A11Q02928 519 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR1Q13613 665 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNJ12Q14500 433 aa24.34■■□□□ 1.49
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms