RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 H7C0C1 242 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRE-201ENST00000254667 ATP5OP48047 213 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRE-201ENST00000254667 VPS41P49754 854 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRE-201ENST00000254667 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRE-201ENST00000254667 GCNT4Q9P109 453 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRE-201ENST00000254667 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRE-201ENST00000254667 MTERF2Q49AM1 385 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRE-201ENST00000254667 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRE-201ENST00000254667 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRE-201ENST00000254667 AFF2P51816 1311 aa20.6■□□□□ 0.89
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PTPRE-201ENST00000254667 MYO1EQ12965 1108 aa20.59■□□□□ 0.89
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PTPRE-201ENST00000254667 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.57■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 FAM170AA1A519 330 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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PTPRE-201ENST00000254667 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRE-201ENST00000254667 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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