RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 CASP1P29466 404 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC8A1P32418 973 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LSP1P33241 339 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 EPS15P42566 896 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SMTNP53814 917 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 EHHADHQ08426 723 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CALCRLQ16602 461 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RRAGAQ7L523 313 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HOOK3Q86VS8 718 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 BAP1Q92560 729 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TLR10Q9BXR5 811 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB17Q9H0T7 212 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0U1RQJ8 604 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GUA9 196 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC53A6NM62 1247 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SRGAP2O75044 1071 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MYBP10242 640 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE6BP35913 854 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V1AP38606 617 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PRKCIP41743 596 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NOVP48745 357 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 USP11P51784 963 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MNAT1P51948 309 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TFAP4Q01664 338 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MECOMQ03112 1051 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PDE4CQ08493 712 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAF1Q13077 416 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS6KA1Q15418 735 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ASIC2Q16515 512 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PTGISQ16647 500 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TXNRD1Q16881 649 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 INF2Q27J81 1249 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 USP38Q8NB14 1042 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RAD54LQ92698 747 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 STAMQ92783 540 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ZIM3Q96PE6 472 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 VCPKMTQ9H867 229 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SLAIN2Q9P270 581 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PARP2Q9UGN5 583 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NHSQ6T4R5 1651 aa8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RCCD1A6NED2 376 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SMCO2A6NFE2 343 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RASSF10A6NK89 507 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 KLRF2D3W0D1 207 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 WNT7AO00755 349 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF263O14978 683 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CETN3O15182 167 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MOCS3O95396 460 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ABL1P00519 1130 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GSTA1P08263 222 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ADCY7P51828 1080 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 STK4Q13043 487 aa8.48□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NEDD9Q14511 834 aa8.48□□□□□ -1.05
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