RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 TBX10O75333 385 aa16.15■□□□□ 0.18
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CS-231ENST00000552222 MMP3P08254 477 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-231ENST00000552222 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
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CS-231ENST00000552222 PDE4DQ08499 809 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-231ENST00000552222 HYAL1Q12794 435 aa16.15■□□□□ 0.18
CS-231ENST00000552222 COL19A1Q14993 1142 aa16.15■□□□□ 0.18
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CS-231ENST00000552222 MAP4K1Q92918 833 aa16.13■□□□□ 0.17
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CS-231ENST00000552222 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 COL4A6Q14031 1691 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 H0Y858 1186 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 STXBP3O00186 592 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 EDNRBP24530 442 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 PSEN2P49810 448 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 ASCL5Q7RTU5 278 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 FBXO11Q86XK2 927 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 CPVLQ9H3G5 476 aa16.12■□□□□ 0.17
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CS-231ENST00000552222 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.12■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
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CS-231ENST00000552222 C7orf31Q8N865 590 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 YME1L1Q96TA2 773 aa16.11■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
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CS-231ENST00000552222 KMT2EQ8IZD2 1858 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 ZNF213O14771 459 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
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CS-231ENST00000552222 FGRP09769 529 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 LINC00271P0C7V0 271 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 THPOP40225 353 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 HAND2P61296 217 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 SYDE2Q5VT97 1194 aa16.1■□□□□ 0.17
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CS-231ENST00000552222 ZNF287Q9HBT7 754 aa16.1■□□□□ 0.17
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CS-231ENST00000552222 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.09■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 PLXNA3P51805 1871 aa16.08■□□□□ 0.17
CS-231ENST00000552222 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.08■□□□□ 0.16
CS-231ENST00000552222 REC8O95072 547 aa16.08■□□□□ 0.16
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