RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	EREG	O14944	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SASH1	O94885	1247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	BPNT1	O95861	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	INPP5B	P32019	993 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CASP7	P55210	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CTSW	P56202	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	FZD5	Q13467	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PRKG1	Q13976	671 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MPP2	Q14168	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	NINJ1	Q92982	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	LRRC3	Q9BY71	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478		A0A1W2PNR3	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478		A0A1W2PP55	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	C9orf172	C9J069	976 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SNAP23	O00161	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	WNT10B	O00744	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF609	O15014	1411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TSPAN6	O43657	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	XYLB	O75191	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	RASGRP1	O95267	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GART	P22102	1010 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TXLNA	P40222	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	STAT3	P40763	770 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TAF5L	O75529	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	RFPL3	O75679	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GJB6	O95452	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ATP4A	P20648	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	FKBP1B	P68106	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SEPT6	Q14141	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GCKR	Q14397	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	JAML	Q86YT9	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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