RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ATP11AP98196 1134 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 COPS6Q7L5N1 327 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MYH7P12883 1935 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 SMAPO00193 183 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 NOX5Q96PH1 765 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 DPH5Q9H2P9 285 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 LY9Q9HBG7 655 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 GOPCQ9HD26 462 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 DAPK3O43293 454 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 SCARF1Q14162 830 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MRC1P22897 1456 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 KCNA6P17658 529 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 UCMAQ8WVF2 138 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 LRRC45Q96CN5 670 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ISCUQ9H1K1 167 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 USP6P35125 1406 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 RAD23BP54727 409 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 A0A087WZG4 1122 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 RRAGAQ7L523 313 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 HIP1RO75146 1068 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ITGA6P23229 1130 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 LRRC14Q15048 493 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 HOMEZQ8IX15 550 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MGARPQ8TDB4 240 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 SHISA4Q96DD7 197 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ADORA1P30542 326 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 PDIA5Q14554 519 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ASB3Q9Y575 518 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 TCIRG1Q13488 830 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ITIH4Q14624 930 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 LRRC53A6NM62 1247 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 PTGDRQ13258 359 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 KCNK3O14649 394 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MYL1P05976 194 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 STAT6P42226 847 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 TNNC1P63316 161 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ADSSL1Q8N142 457 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 COPS2P61201 443 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 PDIA6Q15084 440 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 CCDC38Q502W7 563 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 FOXB2Q5VYV0 432 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PACS1-205ENST00000527224 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 ZAP70P43403 619 aa20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 SLCO1A2P46721 670 aa20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 SESN3P58005 492 aa20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 TEX9Q8N6V9 391 aa20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PACS1-205ENST00000527224 AMACRQ9UHK6 382 aa20.33■□□□□ 0.84
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