RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 PGBD1Q96JS3 809 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 9.9
UBE2Q1-204ENST00000476612 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMEM260Q9NX78 707 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.59□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204ENST00000476612 LRRC37A2A6NM11 1700 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 COL6A3P12111 3177 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 SMCO2A6NFE2 343 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 GOLGA8BA8MQT2 603 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 B4DLN1 442 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZEB2O60315 1214 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PPFIA4O75335 1185 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 REC8O95072 547 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 NEFLP07196 543 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 IQCF3P0C7M6 154 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF286BP0CG31 522 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 TGFB3P10600 412 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 KCNA2P16389 499 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 HOXC8P31273 242 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PBX2P40425 430 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PSEN2P49810 448 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 CPT1AP50416 773 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 RCAN1P53805 252 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 ADAM17P78536 824 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 LAMC2Q13753 1193 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 SESTD1Q86VW0 696 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PPTC7Q8NI37 304 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 AIFM3Q96NN9 605 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PCYT2Q99447 389 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 GPR20Q99678 358 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 HIPK3Q9H422 1215 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 BARHL2Q9NY43 387 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 A0A0C4DFX4 3053 aa4.58□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 NID2Q14112 1375 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM86B1E9PN63 330 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 M0R2N6 131 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 MEIS1O00470 390 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 KPNA6O60684 536 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARHGEF15O94989 841 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 LARGE1O95461 756 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 CTDNEP1O95476 244 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 F2P00734 622 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 LGALS2P05162 132 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 SCG2P13521 617 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 FDPSP14324 419 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 IFNAR1P17181 557 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PSMA5P28066 241 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 NAPAP54920 295 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHMP4BP1P59074 171 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 FPGSQ05932 587 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 ST3GAL1Q11201 340 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 SCRN1Q12765 414 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRAF1Q13077 416 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 MBTPS1Q14703 1052 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 MFSD10Q14728 455 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 DGKDQ16760 1214 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 XRRA1Q6P2D8 792 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 METTL7BQ6UX53 244 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.57□□□□□ -1.68
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRIM50Q86XT4 487 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms