RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 TMTC2Q8N394 836 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 AFAP1L1Q8TED9 768 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 PRDM12Q9H4Q4 367 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 VCANP13611 3396 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC69A6NI79 296 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 SMARCA1P28370 1054 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 GNAQP50148 359 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 RABGGTBP53611 331 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 CREB3L3Q68CJ9 461 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 SPATA33Q96N06 139 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 ALG1Q9BT22 464 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 HDAC6Q9UBN7 1215 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa29.14■■■□□ 2.26
ANKRD28-203ENST00000439830 KIAA0753Q2KHM9 967 aa29.13■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 GNPTABQ3T906 1256 aa29.13■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.13■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 HAS3O00219 553 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 SORBS3O60504 671 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 PPFIA4O75335 1185 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 STAM2O75886 525 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 NECTIN1Q15223 517 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 HSDL1Q3SXM5 330 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 PLEKHA8P1O95397 391 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 CALM1P0DP23 149 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 CALM2P0DP24 149 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 CALM3P0DP25 149 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 LIFRP42702 1097 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 SP2Q02086 613 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 RBL2Q08999 1139 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 PPP2R2DQ66LE6 453 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 CUL5Q93034 780 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC9A7Q96T83 725 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 MLXIPQ9HAP2 919 aa29.11■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 SELPP16109 830 aa29.1■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRC8DQ7L1W4 858 aa29.1■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 RXRAP19793 462 aa29.09■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC12A7Q9Y666 1083 aa29.09■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 TRANK1O15050 2925 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 PIK3CDO00329 1044 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 BAIAP3O94812 1187 aa29.08■■■□□ 2.25
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ANKRD28-203ENST00000439830 MYOGP15173 224 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 ICAM3P32942 547 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF20Q5VTR2 975 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 USP38Q8NB14 1042 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 MICAL3Q7RTP6 2002 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD28-203ENST00000439830 FIBPO43427 364 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 CKBP12277 381 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 PTK7Q13308 1070 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 USP17L6PQ6QN14 398 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 SKAP1Q86WV1 359 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 C16orf70Q9BSU1 422 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.07■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 TTC28Q96AY4 2481 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 NOP56O00567 594 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 NEDD9Q14511 834 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 PCNX4Q63HM2 1172 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 MEIS2O14770 477 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 ADGRE1Q14246 886 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 XRRA1Q6P2D8 792 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 METTL7BQ6UX53 244 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 RTEL1Q9NZ71 1219 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 LGALS2P05162 132 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 CA3P07451 260 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 KCNJ6P48051 423 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 SEMA3FQ13275 785 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 TMTC3Q6ZXV5 915 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 MICU3Q86XE3 530 aa29.04■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 H3BRB1 525 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 IGFBP4P22692 258 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 GPNMBQ14956 572 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 HERC6Q8IVU3 1022 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 FANCBQ8NB91 859 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 BCAS3Q9H6U6 928 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 PSTPIP2Q9H939 334 aa29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ANKRD28-203ENST00000439830 KIF28PB7ZC32 967 aa29.02■■■□□ 2.24
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