RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378979.8

C20orf196-202, Transcript of Uncharacterized protein C20orf196, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf196, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf196-202ENST00000378979 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.29■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 ANO3Q9BYT9 981 aa23.29■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.29■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 MMP3P08254 477 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 CLTBP09497 229 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 ITGA7Q13683 1181 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 NEDD9Q14511 834 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 DGKDQ16760 1214 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 PPTC7Q8NI37 304 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 GPRASP2Q96D09 838 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 STK36Q9NRP7 1315 aa23.28■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 CDK7P50613 346 aa23.27■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 NLRP5P59047 1200 aa23.27■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.27■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 TMEM260Q9NX78 707 aa23.27■■□□□ 1.32
C20orf196-202ENST00000378979 MAFGO15525 162 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 XBP1P17861 261 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 MTMR1Q13613 665 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 ME3Q16798 604 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 WASF1Q92558 559 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 GTF3C6Q969F1 213 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 PGBD1Q96JS3 809 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 SPATA33Q96N06 139 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.26■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 SREBF1P36956 1147 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 PSMC6P62333 389 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 SP2Q02086 613 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 IL27Q8NEV9 243 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.25■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 ITGB5P18084 799 aa23.24■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 ZNF76P36508 570 aa23.24■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 METTL7BQ6UX53 244 aa23.24■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 NECAB1Q8N987 351 aa23.24■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.24■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 JADE2Q9NQC1 790 aa23.24■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 SORBS3O60504 671 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 PPFIA4O75335 1185 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 ARHGAP4P98171 946 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 FAAP100Q0VG06 881 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 SEMA3FQ13275 785 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 RABEP1Q15276 862 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 GALNT17Q6IS24 598 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 KIF2CQ99661 725 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 LARGE1O95461 756 aa23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 CEP55Q53EZ4 464 aa23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 GRIN2DO15399 1336 aa23.22■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 KIAA0355O15063 1070 aa23.21■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 ST18O60284 1047 aa23.21■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 RAG1P15918 1043 aa23.21■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 CHMP4BP1P59074 171 aa23.21■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.21■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 GDF15Q99988 308 aa23.21■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 LTBP2Q14767 1821 aa23.21■■□□□ 1.31
C20orf196-202ENST00000378979 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 CTDNEP1O95476 244 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 CD4P01730 458 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 CYP3A4P08684 503 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 BMP8BP34820 402 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 BLIDQ8IZY5 108 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 AIFM3Q96NN9 605 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.2■■□□□ 1.3
C20orf196-202ENST00000378979 KCNA2P16389 499 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms