RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 ST5P78524 1137 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 MCL1Q07820 350 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 LSAMPQ13449 338 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRSS36Q5K4E3 855 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP128Q6ZU80 1094 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLCO6A1Q86UG4 719 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIRT2Q8IXJ6 389 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXW5Q969U6 566 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC1Q99614 292 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 MTA3Q9BTC8 594 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 C19orf44Q9H6X5 657 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 MKNK2Q9HBH9 465 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 OXSMQ9NWU1 459 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 B4GALT6Q9UBX8 382 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TELO2Q9Y4R8 837 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCDO00767 359 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYO1BO43795 1136 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM253P0C7T8 217 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 GNAT1P11488 350 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRIK1P39086 918 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB27AP51159 221 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCNN1BP51168 640 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 NEK2P51955 445 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 MVKQ03426 396 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKCQQ04759 706 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZP2Q05996 745 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 C2orf69Q8N8R5 385 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLEKHO2Q8TD55 490 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC01599Q8WXQ3 324 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 HOOK2Q96ED9 719 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM169Q96HH4 297 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEP89Q96ST8 783 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 B4E1Z4 1266 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALG1L2C9J202 215 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC27A2O14975 620 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKAP10O43572 662 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSPNO60542 156 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 GAS7O60861 476 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D8O95759 1140 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 NTRK1P04629 796 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 PMLP29590 882 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 LSSP48449 732 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 IRF9Q00978 393 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRIN1Q05586 938 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 IQCEQ6IPM2 695 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYP2R1Q6VVX0 501 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 C16orf59Q7L2K0 433 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 NOSTRINQ8IVI9 506 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUP43Q8NFH3 380 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SP110Q9HB58 689 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 CABP5Q9NP86 173 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNX11Q9Y5W9 270 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 FZD9O00144 591 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 WNT9AO14904 365 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 GSC2O15499 205 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSPAN6O43657 245 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPTXRO95502 500 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYBL2P10244 700 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRKCAP17252 672 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.2 ms