RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288607.2

PSMG3-202, Transcript of proteasome assembly chaperone 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMG3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG3-202ENST00000288607 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 STAM2O75886 525 aa27.93■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 SEC24BO95487 1268 aa27.93■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 SCG2P13521 617 aa27.93■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 NTRK3Q16288 839 aa27.93■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.93■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 PGBD1Q96JS3 809 aa27.93■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa27.93■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 SMCO2A6NFE2 343 aa27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 TIMP1P01033 207 aa27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 TGFB3P10600 412 aa27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 PKN1Q16512 942 aa27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 DGKDQ16760 1214 aa27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 PPTC7Q8NI37 304 aa27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 SPATA33Q96N06 139 aa27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 MYH7BA7E2Y1 1941 aa27.92■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 ICAM3P32942 547 aa27.91■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 STK3Q13188 491 aa27.91■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 HSDL1Q3SXM5 330 aa27.91■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 XRRA1Q6P2D8 792 aa27.91■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 KAT2BQ92831 832 aa27.91■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.91■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 MLXIPQ9HAP2 919 aa27.91■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 TMEM260Q9NX78 707 aa27.91■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa27.9■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 FIBPO43427 364 aa27.9■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF286BP0CG31 522 aa27.9■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 EPHB4P54760 987 aa27.9■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 ANAPC15P60006 121 aa27.9■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 C9orf50Q5SZB4 431 aa27.9■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 UMODL1Q5DID0 1318 aa27.89■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 IFNAR1P17181 557 aa27.89■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 CYP2C18P33260 490 aa27.89■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 FPGSQ05932 587 aa27.89■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 SHHQ15465 462 aa27.89■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 NLRX1Q86UT6 975 aa27.89■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 LRCH3Q96II8 777 aa27.89■■■□□ 2.06
PSMG3-202ENST00000288607 ITGB5P18084 799 aa27.88■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.88■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 ANO3Q9BYT9 981 aa27.88■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 HIPK3Q9H422 1215 aa27.88■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 EHMT1Q9H9B1 1298 aa27.88■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 ADAMTS3O15072 1205 aa27.87■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 CYP2C9P11712 490 aa27.87■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 MFSD5Q6N075 450 aa27.87■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 NFRKBQ6P4R8 1299 aa27.87■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 DOCK5Q9H7D0 1870 aa27.87■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 LAMA3Q16787 3333 aa27.87■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 SP4Q02446 784 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 NEDD9Q14511 834 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 ALG1Q9BT22 464 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 PKD2L1Q9P0L9 805 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 TELO2Q9Y4R8 837 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 CPLX1O14810 134 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 CSF2RAP15509 400 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 PSEN2P49810 448 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 LRIT3Q3SXY7 679 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 GPRASP2Q96D09 838 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.86■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 F2P00734 622 aa27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 FOSP01100 380 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 CCL23P55773 120 aa27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 AP3B2Q13367 1082 aa27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 MFSD10Q14728 455 aa27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 METTL7BQ6UX53 244 aa27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.85■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 ESYT2A0FGR8 921 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 ATP9AO75110 1047 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 PPFIA4O75335 1185 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 MTMR1Q13613 665 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 TMEM199Q8N511 208 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 ZMYND12Q9H0C1 365 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 C6orf50Q9HD87 102 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.84■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 AK2P54819 239 aa27.83■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.83■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.83■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.83■■■□□ 2.05
PSMG3-202ENST00000288607 CDHR1Q96JP9 859 aa27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms