RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
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INO80B-201ENST00000233331 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
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INO80B-201ENST00000233331 EHMT1Q9H9B1 1298 aa35.17■■■■□ 3.22
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INO80B-201ENST00000233331 ANO3Q9BYT9 981 aa35.12■■■■□ 3.21
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INO80B-201ENST00000233331 C6orf50Q9HD87 102 aa35.08■■■■□ 3.21
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INO80B-201ENST00000233331 EPHB4P54760 987 aa35.07■■■■□ 3.2
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INO80B-201ENST00000233331 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP35.05■■■■□ 3.21e-6■■■■□ 25.7
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INO80B-201ENST00000233331 VPS54Q9P1Q0 977 aa35.05■■■■□ 3.2
INO80B-201ENST00000233331 TPCN1Q9ULQ1 816 aa35.05■■■■□ 3.2
INO80B-201ENST00000233331 NOD1Q9Y239 953 aa35.05■■■■□ 3.2
INO80B-201ENST00000233331 CSF2RAP15509 400 aa35.04■■■■□ 3.2
INO80B-201ENST00000233331 GNA11P29992 359 aa35.04■■■■□ 3.2
INO80B-201ENST00000233331 SREBF1P36956 1147 aa35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.2 ms