RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF286B	P0CG31	522 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFB103A	P81534	67 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	GRB10	Q13322	594 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	WNT8B	Q93098	351 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338		B4DLN1	442 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF213	O14771	459 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	NBN	O60934	754 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	SELP	P16109	830 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	RBL2	Q08999	1139 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	IL25	Q9H293	177 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TLL1	O43897	1013 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS20	O76081	388 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	F2	P00734	622 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CXCL10	P02778	98 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CKB	P12277	381 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNJ6	P48051	423 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HIC1	Q14526	733 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	STXBP2	Q15833	593 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HAS3	O00219	553 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CFB	P00751	764 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	NR3C2	P08235	984 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PSEN2	P49810	448 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	HSD17B4	P51659	736 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	DGKD	Q16760	1214 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MAF1	Q9H063	256 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	SORBS3	O60504	671 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHD	P01880	384 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	GHRHR	Q02643	423 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD10	Q14728	455 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		13.92	□□□□□ -0.18

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