RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.53□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.53□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXL5Q9UKA1 691 aa8.53□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.53□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.53□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 H0YHG0 523 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 STXBP3O00186 592 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOC5O00471 708 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ENC1O14682 589 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDM1O75626 825 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R37O75864 691 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC172P0C7W6 258 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CCT5P48643 541 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NPEPPSP55786 919 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP4CP60510 307 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SLMAPQ14BN4 828 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 IL17AQ16552 155 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC18A3Q16572 532 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SUSD4Q5VX71 490 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT79Q5XKE5 535 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PACS2Q86VP3 889 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC65Q8IXS2 484 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SHISA4Q96DD7 197 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CAPZA3Q96KX2 299 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ISCUQ9H1K1 167 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SLIT2O94813 1529 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GRIN2DO15399 1336 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.52□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CHUKO15111 745 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CAMTA2O94983 1202 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PAEPP09466 180 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MYZAPP0CAP1 466 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HSPA6P17066 643 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NR1D1P20393 614 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CDC25AP30304 524 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 NAPAP54920 295 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf54Q08AI8 447 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PTPN21Q16825 1174 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ASPRV1Q53RT3 343 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HYIQ5T013 277 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 C12orf60Q5U649 245 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPTQ96BT3 561 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 INCENPQ9NQS7 918 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A0G2JS52 829 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 FLOT1O75955 427 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPY3P0CV98 308 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPY8P0CW00 308 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 GHRP10912 638 aa8.5□□□□□ -1.05
CAPNS1-202ENST00000586851 RFX1P22670 979 aa8.5□□□□□ -1.05
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