RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564601.5

RNPS1-210, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene RNPS1, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-210ENST00000564601 GRIN2CQ14957 1233 aa22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 HERVK_113Q902F9 699 aa22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 SCLYQ96I15 445 aa22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 IWS1Q96ST2 819 aa22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 MCM5P33992 734 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 TRAF1Q13077 416 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 TTLL4Q14679 1199 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 NECTIN1Q15223 517 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 LY6KQ17RY6 165 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 PIGSQ96S52 555 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 PXMP2Q9NR77 195 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 DDAH1O94760 285 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 STXBP2Q15833 593 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 IL31RAQ8NI17 732 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 KAT2BQ92831 832 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 TMEM87BQ96K49 555 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 MAP3K14Q99558 947 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-210ENST00000564601 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 MMP3P08254 477 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 FOSL2P15408 326 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 AFG1LQ8WV93 481 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 MYL10Q9BUA6 226 aa22.26■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 KIF5BP33176 963 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 TMTC2Q8N394 836 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 TIFAQ96CG3 184 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 CDC45O75419 566 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 NR3C2P08235 984 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 RNF20Q5VTR2 975 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 USP38Q8NB14 1042 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 ZNF576Q9H609 170 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 CCDC69A6NI79 296 aa22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 KPNA6O60684 536 aa22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 LIFRP42702 1097 aa22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 GH1P01241 217 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 FGBP02675 491 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 POLR2MP0CAP2 368 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.22■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 CALM1P0DP23 149 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 CALM2P0DP24 149 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 CALM3P0DP25 149 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 SMARCA1P28370 1054 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 GNAQP50148 359 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 GPNMBQ14956 572 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 PGM5Q15124 567 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 SESTD1Q86VW0 696 aa22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RNPS1-210ENST00000564601 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 SP2Q02086 613 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 HIC1Q14526 733 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 MYO9BQ13459 2157 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 TTC28Q96AY4 2481 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 HAS3O00219 553 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 PITPNM1O00562 1244 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-210ENST00000564601 MYOGP15173 224 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms