RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 BPNT1O95861 308 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 SOX10P56693 466 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 TMC4Q7Z404 712 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 OXR1Q8N573 874 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL3Q9UH77 587 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 C4BP0C0L5 1744 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 RASSF10A6NK89 507 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 HTR3BO95264 441 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 INHBBP09529 407 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNA5P30532 468 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 RFC4P35249 363 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 LDHDQ86WU2 507 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 SHISA4Q96DD7 197 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 PASKQ96RG2 1323 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRK-211ENST00000429595 CA12O43570 354 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 NUAK1O60285 661 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 EFEMP2O95967 443 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 TNNI2P48788 182 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 GALK1P51570 392 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF605Q86T29 641 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 VWCEQ96DN2 955 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 ASPNQ9BXN1 380 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 NOTOA8MTQ0 251 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 PSPNO60542 156 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 18.7
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO27Q8NI29 283 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 CRELD1Q96HD1 420 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM74Q96NL1 305 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 NCANO14594 1321 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 DLG4P78352 724 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 CAPNS2Q96L46 248 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 KIF2CQ99661 725 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 GCM1Q9NP62 436 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 PRRG2O14669 202 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 GARTP22102 1010 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 IP6K1Q92551 441 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 GPR160Q9UJ42 338 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 NFAT5O94916 1531 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 SBF1O95248 1867 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 PEX10O60683 326 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 SEMA7AO75326 666 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 GYS1P13807 737 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 MAP2K2P36507 400 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNEQ04844 493 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 REC114Q7Z4M0 266 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 EVC2Q86UK5 1308 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 TTLL6Q8N841 843 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 SGPP1Q9BX95 441 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 B8ZZF3 427 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 AMPHP49418 695 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 DUSP4Q13115 394 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 MPP2Q14168 576 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 CNTROBQ8N137 903 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-211ENST00000429595 C20orf173Q96LM9 149 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 523.7 ms