RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fcn1O70165 334 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TxnP10639 105 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccl5P30882 91 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lpar1P61793 364 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp8a2P98200 1148 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Atp2b3Q0VF55 1220 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vamp1Q62442 118 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Znf280dQ68FE8 974 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dcaf15Q6PFH3 600 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ube3cQ80U95 1083 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmco5bQ80X59 307 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 B430218F22RikQ8BQR5 223 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppme1Q8BVQ5 386 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PaoxQ8C0L6 504 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q8CC96 669 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Btbd7Q8CFE5 1130 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dnajc22Q8CHS2 339 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ubxn4Q8VCH8 506 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam217aQ9D9W6 419 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SelenooQ9DBC0 667 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Epb41l3Q9WV92 929 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cep295Q8BQ48 2412 aa6.58□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Frmpd4A2AFR3 1320 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Aox4Q3TYQ9 1336 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Phactr2B1AVP0 632 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc27a3O88561 667 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wnt11P48615 354 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrgprb1Q3UG61 350 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Babam1Q3UI43 333 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clca4aQ6Q473 924 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adamtsl2Q7TSK7 957 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 C130026I21RikQ8C898 291 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Alas1Q8VC19 642 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc7a13Q91WN3 478 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bco2Q99NF1 532 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pidd1Q9ERV7 915 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tle2Q9WVB2 767 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Magi2Q9WVQ1 1275 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cep290Q6A078 2472 aa6.57□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adgra3Q7TT36 1310 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Izumo3A6PWV3 263 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Supt3B0QZW4 406 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MstnO08689 376 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vcam1P29533 739 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Eef2P58252 858 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbx3P70324 741 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stim2P83093 746 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zscan21Q07231 555 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Parp3Q3ULW8 533 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp341Q6PGC9 846 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pramel7Q810Y8 479 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Osbpl2Q8BX94 484 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc60Q8C4J0 545 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q8C5K5 320 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fam126bQ8C729 530 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trex1Q91XB0 314 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HlcsQ920N2 722 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sppl3Q9CUS9 384 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fsip1Q9D3V5 435 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lypd2Q9DD23 127 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Acot3Q9QYR7 432 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gabbr1Q9WV18 960 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Deaf1Q9Z1T5 566 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa6.56□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nphp3Q7TNH6 1325 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AV320801A2AWL3 467 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gml2G5E8L7 176 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm15023L7MUB4 467 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tuft1O08970 390 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pgk2P09041 417 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P4hbP09103 509 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hoxc6P10629 235 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klrb1bP27812 223 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stat5bP42232 786 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GlrbP48168 496 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ncf1Q09014 390 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kiaa0753Q6A000 959 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ScapQ6GQT6 1276 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc154Q6RUT8 657 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adam20Q7M763 760 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 KhnynQ80U38 671 aa6.55□□□□□ -1.36
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dars2Q8BIP0 653 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.8 ms