RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 RCAN1P53805 252 aa21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 PXMP2Q9NR77 195 aa21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 PHF24Q9UPV7 400 aa21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 B4DLN1 442 aa21.48■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 GJA9P57773 515 aa21.48■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.48■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.48■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 IWS1Q96ST2 819 aa21.48■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.48■■□□□ 1.03
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GCSHP2-201ENST00000560971 ALPK3Q96L96 1907 aa21.47■■□□□ 1.03
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GCSHP2-201ENST00000560971 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNA10Q16322 511 aa21.47■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.47■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TLK2Q86UE8 772 aa21.47■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.47■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SPC25Q9HBM1 224 aa21.47■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.47■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 NR3C2P08235 984 aa21.46■■□□□ 1.03
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GCSHP2-201ENST00000560971 STXBP2Q15833 593 aa21.46■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 GNASQ5JWF2 1037 aa21.46■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.46■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.46■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PQY0 241 aa21.45■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 CST5P28325 142 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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GCSHP2-201ENST00000560971 PPP2R5BQ15173 497 aa21.45■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 C8orf34Q49A92 452 aa21.45■■□□□ 1.02
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GCSHP2-201ENST00000560971 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.45■■□□□ 1.02
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GCSHP2-201ENST00000560971 IL31RAQ8NI17 732 aa21.45■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.45■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.45■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 NID2Q14112 1375 aa21.45■■□□□ 1.02
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GCSHP2-201ENST00000560971 SCFD2Q8WU76 684 aa21.44■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 COPS5Q92905 334 aa21.44■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.44■■□□□ 1.02
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GCSHP2-201ENST00000560971 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 ASGR1P07306 291 aa21.43■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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GCSHP2-201ENST00000560971 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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GCSHP2-201ENST00000560971 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.43■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 Q9Y3F1 56 aa21.43■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 PIK3CDO00329 1044 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 SYN1P17600 705 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 TTLL4Q14679 1199 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 UBE2SQ16763 222 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.42■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP290O15078 2479 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 RGS20O76081 388 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 NAPAP54920 295 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 SNX17Q15036 470 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 NTRK3Q16288 839 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 LY6KQ17RY6 165 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM60Q495X7 471 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 PHKBQ93100 1093 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 IL17RAQ96F46 866 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.41■■□□□ 1.02
GCSHP2-201ENST00000560971 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.4■■□□□ 1.02
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