RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549181.5

SLC8B1-207, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 3

Gene SLC8B1, Length 925 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-207ENST00000549181 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 RXRAP19793 462 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 PTGS1P23219 599 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 BMP8BP34820 402 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 PPP2R5BQ15173 497 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 MICU3Q86XE3 530 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 IWS1Q96ST2 819 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 HSPA4P34932 840 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 TLE2Q04725 743 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 KCNB2Q92953 911 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 PXMP2Q9NR77 195 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 ZEB2O60315 1214 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 APOA5Q6Q788 366 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 CLTBP09497 229 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 STXBP2Q15833 593 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 FANCBQ8NB91 859 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 CABYRO75952 493 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 POLR2MP0CAP2 368 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 TTLL4Q14679 1199 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 TOX2Q96NM4 488 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SLC8B1-207ENST00000549181 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 SLC34A2O95436 690 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 NR3C2P08235 984 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 CPT1AP50416 773 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 ARVCFO00192 962 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 ZBTB43O43298 467 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 ARIH2O95376 493 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 FGD1P98174 961 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 CPA1P15085 419 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 CDK7P50613 346 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 PGM5Q15124 567 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 RTN1Q16799 776 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 TDHQ8IZJ6 230 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 COPS5Q92905 334 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 LAMA3Q16787 3333 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 KIAA0355O15063 1070 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 RCAN1P53805 252 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 FAAP100Q0VG06 881 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.79■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.78■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.78■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 ITGA7Q13683 1181 aa21.78■■□□□ 1.08
SLC8B1-207ENST00000549181 Q6ZUG5 572 aa21.78■■□□□ 1.08
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