RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	RTN1	Q16799	776 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	STAM2	O75886	525 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	RAG1	P15918	1043 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CCND2	P30279	289 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	BMP8B	P34820	402 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	HSPA4	P34932	840 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	RCAN1	P53805	252 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX17	Q15036	470 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	KATNBL1	Q9H079	304 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PXMP2	Q9NR77	195 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	ARVCF	O00192	962 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	GH1	P01241	217 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	NR3C2	P08235	984 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MYL3	P08590	195 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	EDNRB	P24530	442 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	HSD17B4	P51659	736 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	BEX3	Q00994	111 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TLE2	Q04725	743 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	RXRA	P19793	462 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	NKX3-2	P78367	333 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZUG5	572 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CYTH3	O43739	400 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TGFB3	P10600	412 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	GHRHR	Q02643	423 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	GDF15	Q99988	308 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	ASTN1	O14525	1302 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	NAPA	P54920	295 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PGM5	Q15124	567 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	DGKD	Q16760	1214 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.03	□□□□□ -0.32

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