RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SOWAHDA6NJG2 315 aa19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERLIN1O75477 346 aa19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PBX1P40424 430 aa19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAP3K10Q02779 954 aa19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TYW1BQ6NUM6 668 aa19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAD9BQ6WBX8 426 aa19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PIGSQ96S52 555 aa19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FECHP22830 423 aa19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EPS15P42566 896 aa19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RILPL1Q5EBL4 403 aa19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLFN13Q68D06 897 aa19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCTD1Q719H9 257 aa19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEFB129Q9H1M3 183 aa19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BARHL2Q9NY43 387 aa19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 L1RE1Q9UN81 338 aa19.31■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STXBP3O00186 592 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPS6KA5O75582 802 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DDNO94850 711 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LMAN1P49257 510 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPECC1Q5M775 1068 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TTBK2Q6IQ55 1244 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DCAF4Q8WV16 495 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATAD5Q96QE3 1844 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TUBBP07437 444 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC1A4P43007 532 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPATA1Q5VX52 437 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPFIBP1Q86W92 1011 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TNFRSF25Q93038 417 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC51Q96ER9 411 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RASSF4Q9H2L5 321 aa19.3■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A1W2PRG0 241 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM205CA6NFA0 338 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VGLL3A8MV65 326 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 F5H6K3 240 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CALML3P27482 149 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CAP2P40123 477 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GYS2P54840 703 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GRIN1Q05586 938 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KLRC3Q07444 240 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C9orf131Q5VYM1 1079 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC148Q8NFR7 591 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDE11AQ9HCR9 933 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LZTFL1Q9NQ48 299 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYO1CO00159 1063 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC16A2P36021 539 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBL2Q08999 1139 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ADGRF4Q8IZF3 695 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ADAMTS3O15072 1205 aa19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TEX33O43247 280 aa19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NDUFB10O96000 172 aa19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IVLP07476 585 aa19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGSF22Q8N9C0 903 aa19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CTAGE1Q96RT6 745 aa19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PNKPQ96T60 521 aa19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 JMJD4Q9H9V9 463 aa19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCDHA4Q9UN74 947 aa19.28■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MFAP3LO75121 409 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ECE1P42892 770 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDKAL1Q5VV42 579 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SRLQ86TD4 932 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BLIDQ8IZY5 108 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACER1Q8TDN7 264 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GBP3Q9H0R5 595 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GGA3Q9NZ52 723 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CEP131Q9UPN4 1083 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ITIH6Q6UXX5 1313 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CTAGE9A4FU28 777 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PHF20L1A8MW92 1017 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NAPAP54920 295 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GMCL1Q96IK5 515 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa19.27■□□□□ 0.68
USP27X-AS1-201ENST00000437322 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.67
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP2B1P20020 1258 aa19.26■□□□□ 0.67
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CUL4BQ13620 913 aa19.26■□□□□ 0.67
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF569Q5MCW4 686 aa19.26■□□□□ 0.67
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LEKR1Q6ZMV7 388 aa19.26■□□□□ 0.67
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa19.26■□□□□ 0.67
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABCB6Q9NP58 842 aa19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms