RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC181Q5TID7 509 aa16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 BLIDQ8IZY5 108 aa16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MOCS3O95396 460 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 USP17L8P0C7I0 530 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 UBA7P41226 1012 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC91Q7Z6B0 441 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CNPY4Q8N129 248 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PP2D1A8MPX8 630 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 LCA5LO95447 670 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SAMM50Q9Y512 469 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MYH10P35580 1976 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFAB1O14561 156 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD40Q6AI12 368 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MYH1P12882 1939 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R2P41236 205 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PAFAH1B1P43034 410 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 KIF11P52732 1056 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PDCLQ13371 301 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf74Q6P047 294 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 EEF2KMTQ96G04 330 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CUEDC2Q9H467 287 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CACNA1SQ13698 1873 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ZIM3Q96PE6 472 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ZEB2O60315 1214 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 APBA1Q02410 837 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PLIN2Q99541 437 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TOM1O60784 492 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CLSTN1O94985 981 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PDE4DQ08499 809 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM60Q9H2L4 133 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GUL6 1792 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ORC4O43929 436 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA0754O94854 1291 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CXCR5P32302 372 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RFC4P35249 363 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MNAT1P51948 309 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 VPS72Q15906 364 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC15Q8TF66 581 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PJA2O43164 708 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TM4SF1P30408 202 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PSMB7Q99436 277 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 EHD2Q9NZN4 543 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 KIF5BP33176 963 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TFAP4Q01664 338 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 NFIXQ14938 502 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC178Q5BJE1 867 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 IFT20Q8IY31 132 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RASGRP4Q8TDF6 673 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 PAGR1Q9BTK6 254 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM9Q9C026 710 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 CAPN7Q9Y6W3 813 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 LAMB2P55268 1798 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 LAD1O00515 517 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 AKR1B10O60218 316 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 FSBPO95073 299 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 FNTAP49354 379 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 STK4Q13043 487 aa16.53■□□□□ 0.24
TOP3B-206ENST00000436282 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.53■□□□□ 0.24
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