RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AK2P54819 239 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNFAIP2Q03169 654 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WWC2Q6AWC2 1192 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF180Q86T96 592 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCHSD1Q86WN1 690 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C22orf23Q9BZE7 217 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C11orf49Q9H6J7 331 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSTPIP2Q9H939 334 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPC25Q9HBM1 224 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PXMP2Q9NR77 195 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMCHD1A6NHR9 2005 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H0YGN5 161 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIK3CDO00329 1044 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPLX1O14810 134 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGK1P00558 417 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFNAR1P17181 557 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADCYAP1R1P41586 468 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEK4P51957 841 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAPAP54920 295 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STK3Q13188 491 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STXBP2Q15833 593 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IQSEC1Q6DN90 963 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAPT1Q6NXT6 567 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa19.99■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LCTP09848 1927 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADCY6O43306 1168 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCG2P13521 617 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC41Q15345 812 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHKBQ93100 1093 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDGFCQ9NRA1 345 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BARHL2Q9NY43 387 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SZT2Q5T011 3432 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa19.98■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC37A2A6NM11 1700 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STXBP3O00186 592 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MEIS2O14770 477 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NR3C2P08235 984 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM25P49756 843 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NTRK3Q16288 839 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP17L6PQ6QN14 398 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEX2Q8IWB9 1127 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM22Q8IYM9 498 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCFD2Q8WU76 684 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC26A6Q9BXS9 759 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TPCN1Q9ULQ1 816 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYH6P13533 1939 aa19.97■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAMTS4O75173 837 aa19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL6A1P12109 1028 aa19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMPD1P17405 629 aa19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PGM5Q15124 567 aa19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TLK2Q86UE8 772 aa19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR11Q9BZH6 1224 aa19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PFKFB2O60825 505 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDKL5O76039 1030 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCND2P30279 289 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADCY7P51828 1080 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GJA9P57773 515 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTLL4Q14679 1199 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DUSP28Q4G0W2 176 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TYW1BQ6NUM6 668 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AP5M1Q9H0R1 490 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLT8D2Q9H1C3 349 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q9Y3F1 56 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FRMPD4Q14CM0 1322 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FRMPD3Q5JV73 1810 aa19.95■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPDYE3A6NKU9 549 aa19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPFIA3O75145 1194 aa19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CST5P28325 142 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCRN1Q12765 414 aa19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PKN1Q16512 942 aa19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBE2SQ16763 222 aa19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPF3Q92784 378 aa19.94■□□□□ 0.78
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms