RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 HERVK_113Q902F9 699 aa29.79■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 HIPK3Q9H422 1215 aa29.79■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 UMODL1Q5DID0 1318 aa29.78■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 GRXCR1A8MXD5 290 aa29.78■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 SENP2Q9HC62 589 aa29.78■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.77■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 GOLGA8HP0CJ92 632 aa29.77■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 PBX2P40425 430 aa29.77■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 CLEC4DQ8WXI8 215 aa29.77■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 KCNB2Q92953 911 aa29.77■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
RP9-201ENST00000297157 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 B4GALT4O60513 344 aa29.76■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 TROAPQ12815 778 aa29.76■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 CHD7Q9P2D1 2997 aa29.76■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 PNMA2Q9UL42 364 aa29.76■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 PSMC6P62333 389 aa29.75■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.75■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 USP38Q8NB14 1042 aa29.75■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 TRPV6Q9H1D0 765 aa29.75■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 WNT8AQ9H1J5 351 aa29.75■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 CHST3Q7LGC8 479 aa29.74■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.74■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 LY9Q9HBG7 655 aa29.74■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.74■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 MUC3AQ02505 3323 aa29.73■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 MTMR8Q96EF0 704 aa29.73■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 WDR11Q9BZH6 1224 aa29.73■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 CPVLQ9H3G5 476 aa29.73■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 GBF1Q92538 1859 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 PTPDC1A2A3K4 754 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 EDNRBP24530 442 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 MCM5P33992 734 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 GRM4Q14833 912 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 WTAPQ15007 396 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 RNF20Q5VTR2 975 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 RASEFQ8IZ41 740 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 STAG2Q8N3U4 1231 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 VWCEQ96DN2 955 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 POLR3EQ9NVU0 708 aa29.72■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 ERICH2A1L162 156 aa29.71■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 FGBP02675 491 aa29.71■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 PURAQ00577 322 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 RAB30Q15771 203 aa29.71■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.71■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.71■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.71■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 TMEM87BQ96K49 555 aa29.71■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 MAP3K14Q99558 947 aa29.71■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 PRC1O43663 620 aa29.7■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 CPT1AP50416 773 aa29.7■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 CCL23P55773 120 aa29.7■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 RPS6P62753 249 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 MAF1Q9H063 256 aa29.7■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.7■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
RP9-201ENST00000297157 MYO9BQ13459 2157 aa29.7■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 CALML3P27482 149 aa29.69■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 LIFRP42702 1097 aa29.69■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 DNERQ8NFT8 737 aa29.69■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 KLRF2D3W0D1 207 aa29.68■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 OTOP2Q7RTS6 562 aa29.68■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 PRDM12Q9H4Q4 367 aa29.68■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 MSRAQ9UJ68 235 aa29.68■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP29.67■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 HSPA4P34932 840 aa29.67■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 TMTC2Q8N394 836 aa29.67■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 RGS22Q8NE09 1264 aa29.67■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 OR6J1Q8NGC5 347 aa29.67■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.67■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa29.66■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 PDE4DQ08499 809 aa29.66■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 PPP2R5BQ15173 497 aa29.66■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.66■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.66■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 SCFD2Q8WU76 684 aa29.66■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 DDAH1O94760 285 aa29.65■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 QRICH1Q2TAL8 776 aa29.65■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 SCLYQ96I15 445 aa29.65■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 NEK1Q96PY6 1258 aa29.65■■■□□ 2.34
RP9-201ENST00000297157 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms