RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189849.6

Cys1-208, Transcript of Cystin-1, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cys1, Length 1,828 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Znf608	Q56A10	1511 aa		32.62	■■■□□ 2.81
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ak9	G3UYQ4	1894 aa		32.6	■■■□□ 2.81
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Setbp1	Q9Z180	1582 aa		32.59	■■■□□ 2.81
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Arhgef40	Q3UPH7	1517 aa		32.54	■■■□□ 2.8
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Rnf17	Q99MV7	1640 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Mlh3	A0A1Y7VMP7	1443 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Mier1	Q5UAK0	511 aa		32.49	■■■□□ 2.79
Cys1-208	ENSMUST00000189849	A2m	Q6GQT1	1474 aa		32.48	■■■□□ 2.79
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Caskin1	Q6P9K8	1431 aa		32.48	■■■□□ 2.79
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Pprc1	Q6NZN1	1644 aa		32.48	■■■□□ 2.79
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Arhgap5	P97393	1501 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Arid3c	A6PWV5	409 aa		32.46	■■■□□ 2.79
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Acin1	Q9JIX8	1338 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Kdm6b	Q5NCY0	1641 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Tdrd9	Q14BI7	1383 aa		32.4	■■■□□ 2.78
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Cdk11b	P24788	784 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Fam50a	Q9WV03	339 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Plekhh2	Q8C115	1491 aa		32.37	■■■□□ 2.77
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ttbk1	Q6PCN3	1308 aa		32.34	■■■□□ 2.77
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Gm32742	A0A1B0GT42	1604 aa		32.34	■■■□□ 2.77
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Naip2	Q9QUK4	1447 aa		32.34	■■■□□ 2.77
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Dnajc5	P60904	198 aa		32.33	■■■□□ 2.77
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Abcc5	Q9R1X5	1436 aa		32.33	■■■□□ 2.77
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Cfap74	Q3UY96	1578 aa		32.33	■■■□□ 2.77
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Pdcd11	Q6NS46	1862 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Zfyve16	Q80U44	1528 aa		32.31	■■■□□ 2.76
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Mtus2	Q3UHD3	1353 aa		32.31	■■■□□ 2.76
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Clasp1	Q80TV8	1535 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Mia2	Q91ZV0	1396 aa		32.26	■■■□□ 2.75
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Uaca	Q8CGB3	1411 aa		32.25	■■■□□ 2.75
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Chic2	Q9D9G3	165 aa		32.23	■■■□□ 2.75
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ppp1r18	Q8BQ30	594 aa		32.2	■■■□□ 2.75
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Abca9	Q8K449	1623 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Trappc8	E9PWG2	1437 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Fhad1	A6PWD2	1420 aa		32.19	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Abcc3	B2RX12	1523 aa		32.18	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ttc37	F8VPK0	1563 aa		32.17	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Cabp1	Q9JLK7	227 aa		32.16	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Hecw1	Q8K4P8	1604 aa		32.16	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Depdc5	P61460	1591 aa		32.16	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Kidins220	E9Q9B7	1793 aa		32.16	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Rfx7	F8VPJ6	1459 aa		32.15	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Vps8	Q0P5W1	1427 aa		32.14	■■■□□ 2.74
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Il16	O54824	1322 aa		32.13	■■■□□ 2.73
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Agl	F8VPN4	1532 aa		32.11	■■■□□ 2.73
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Kdm3b	Q6ZPY7	1562 aa		32.1	■■■□□ 2.73
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Sphkap	Q6NSW3	1687 aa		32.09	■■■□□ 2.73
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Fmn2	Q9JL04	1578 aa		32.09	■■■□□ 2.73
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Sart1	Q9Z315	806 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Cdc42bpb	Q7TT50	1713 aa		32.04	■■■□□ 2.72
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Mast1	Q9R1L5	1570 aa		32.04	■■■□□ 2.72
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ncl	P09405	707 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Adgrb2	Q8CGM1	1561 aa		32.02	■■■□□ 2.72
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Neurl4	Q5NCX5	1563 aa		31.99	■■■□□ 2.71
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Adgb	G3UZ78	1657 aa		31.99	■■■□□ 2.71
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Lemd3	Q9WU40	921 aa		31.94	■■■□□ 2.7
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Adgrl2	Q8JZZ7	1487 aa		31.94	■■■□□ 2.7
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Rpgrip1	Q9EPQ2	1331 aa		31.93	■■■□□ 2.7
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Dennd4b	Q3U1Y4	1499 aa		31.92	■■■□□ 2.7
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ovos	Q3UU35	1456 aa		31.9	■■■□□ 2.7
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ube2u	B1AUC4	352 aa		31.89	■■■□□ 2.69
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Kiaa0556	Q8C753	1610 aa		31.88	■■■□□ 2.69
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Rrp7a	Q9D1C9	280 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ccer2	J3QPU5	274 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Nefm	P08553	848 aa		31.84	■■■□□ 2.69
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Kdm5c	P41230	1554 aa		31.83	■■■□□ 2.69
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Prdm16	A2A935	1275 aa		31.81	■■■□□ 2.68
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Fhod3	Q76LL6	1578 aa		31.8	■■■□□ 2.68
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Alk	P97793	1621 aa		31.78	■■■□□ 2.68
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Map3k5	O35099	1380 aa		31.78	■■■□□ 2.68
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Fndc1	E9Q043	1732 aa		31.77	■■■□□ 2.68
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Xrn1	P97789	1719 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Atp10a	O54827	1508 aa		31.73	■■■□□ 2.67
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ssh2	Q5SW75	1423 aa		31.73	■■■□□ 2.67
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Hecw2	Q6I6G8	1578 aa		31.72	■■■□□ 2.67
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Abca17	E9PX95	1733 aa		31.72	■■■□□ 2.67
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Cul9	Q80TT8	1865 aa		31.7	■■■□□ 2.67
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Zfp644	E9QA22	1323 aa		31.69	■■■□□ 2.66
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Synj2	Q9D2G5	1434 aa		31.68	■■■□□ 2.66
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Nos1	Q9Z0J4	1429 aa		31.68	■■■□□ 2.66
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ptch1	Q61115	1434 aa		31.67	■■■□□ 2.66
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Dip2c	E9PWR4	1557 aa		31.67	■■■□□ 2.66
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Rere	Q80TZ9	1558 aa		31.67	■■■□□ 2.66
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Trpm2	Q91YD4	1506 aa		31.65	■■■□□ 2.66
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Spag9	Q58A65	1321 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Nup155	Q99P88	1391 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Ankrd36	D3Z4K0	1415 aa		31.62	■■■□□ 2.65
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Lamc1	P02468	1607 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Cdc42bpg	Q80UW5	1551 aa		31.59	■■■□□ 2.65
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Usp54	Q8BL06	1588 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Znf518a	B2RRF6	1478 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Kif21b	Q9QXL1	1668 aa		31.58	■■■□□ 2.65
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Eid3	Q3V124	375 aa		31.58	■■■□□ 2.65
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Mphosph9	A6H5Y1	991 aa		31.57	■■■□□ 2.64
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Clstn2	Q9ER65	966 aa		31.56	■■■□□ 2.64
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Supt6h	Q62383	1726 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Zbtb7c	Q8VCZ7	619 aa		31.54	■■■□□ 2.64
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Kif1b	Q60575	1816 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Map4	P27546	1125 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
Cys1-208	ENSMUST00000189849	Shprh	Q7TPQ3	1674 aa		31.51	■■■□□ 2.63

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.5 ms