RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.53■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF236Q9UL36 1845 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 STXBP3O00186 592 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 DTNBO60941 627 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 POLR2MP0CAP2 368 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC30A10Q6XR72 485 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 RGS22Q8NE09 1264 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 APBA2Q99767 749 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 ALG1Q9BT22 464 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 PSTPIP2Q9H939 334 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 GJD2Q9UKL4 321 aa15.52■□□□□ 0.08
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMCO2A6NFE2 343 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ADCY7P51828 1080 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 NLRP5P59047 1200 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 IRF5Q13568 498 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRIM29Q14134 588 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 C6orf50Q9HD87 102 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 SMC3Q9UQE7 1217 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTPN22Q9Y2R2 807 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ADCY3O60266 1144 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 COBLO75128 1261 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 GNA11P29992 359 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 BECN1Q14457 450 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 BICD2Q8TD16 824 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 TBC1D5Q92609 795 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 USP6NLQ92738 828 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 AIFM3Q96NN9 605 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ESYT2A0FGR8 921 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 B4DLN1 442 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 OPLAHO14841 1288 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 HOXC6P09630 235 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 HSD17B4P51659 736 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 FOSBP53539 338 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 CNTN2Q02246 1040 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF792Q3KQV3 632 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM133AQ8N9E0 248 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 GHRHRQ02643 423 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 CUL4AQ13619 759 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 UBE2SQ16763 222 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ARHGEF16Q5VV41 709 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAML3Q96JK9 1138 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ASB14A6NK59 587 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 PIK3CDO00329 1044 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ELNP15502 786 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 GJB2P29033 226 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 GRK4P32298 578 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCL14Q16627 93 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 MCTP2Q6DN12 878 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 DNERQ8NFT8 737 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 C8orf76Q96K31 380 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 TAAR1Q96RJ0 339 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 RMDN3Q96TC7 470 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1-209ENST00000566833 MEIS2O14770 477 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms