RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 DPF3Q92784 378 aa21.58■■□□□ 1.05
GCSHP2-201ENST00000560971 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.58■■□□□ 1.05
GCSHP2-201ENST00000560971 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
GCSHP2-201ENST00000560971 ADCY6O43306 1168 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 COL6A1P12109 1028 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RPS6KB1P23443 525 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 FGD1P98174 961 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MORC4Q8TE76 937 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 COL20A1Q9P218 1284 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MCM3APO60318 1980 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 DNM1LO00429 736 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PGK1P00558 417 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PSMA5P28066 241 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SMARCA1P28370 1054 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 GNAQP50148 359 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC41Q15345 812 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.56■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MYH6P13533 1939 aa21.55■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB43O43298 467 aa21.55■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 CFBP00751 764 aa21.55■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 APOBRQ0VD83 1088 aa21.55■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 BRF1Q92994 677 aa21.55■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.54■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ADCYAP1R1P41586 468 aa21.54■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TAPT1Q6NXT6 567 aa21.54■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 DNERQ8NFT8 737 aa21.54■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MAF1Q9H063 256 aa21.54■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.54■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.54■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 KBTBD13C9JR72 458 aa21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PTGS1P23219 599 aa21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 HSD17B4P51659 736 aa21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAF1Q13077 416 aa21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RTN1Q16799 776 aa21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RUFY3Q7L099 469 aa21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAMTS4O75173 837 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SEC24BO95487 1268 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 EDNRBP24530 442 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 GHRHRQ02643 423 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TNFAIP2Q03169 654 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PDE4DQ08499 809 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF180Q86T96 592 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RMDN3Q96TC7 470 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 VTA1Q9NP79 307 aa21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.52■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 MYADML2A6NDP7 307 aa21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 EVI5O60447 810 aa21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SMPD1P17405 629 aa21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CDC27P30260 824 aa21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 FBXL16Q8N461 479 aa21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 FERMT2Q96AC1 680 aa21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.51■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 H0YGN5 161 aa21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 POLR2MP0CAP2 368 aa21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 FUT2Q10981 343 aa21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.5■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GCSHP2-201ENST00000560971 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms