RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POTEB3A0JP26 581 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POTEBQ6S5H4 581 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NCLNQ969V3 563 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TADA1Q96BN2 335 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GFPT2O94808 682 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SERPINB6P35237 376 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGAP4P98171 946 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGAP25P42331 645 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 INHBEP58166 350 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AVL9Q8NBF6 648 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CARD6Q9BX69 1037 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STK38LQ9Y2H1 464 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PSMD14O00487 310 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TSPY1Q01534 308 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 INAVAQ3KP66 663 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NKX2-3Q8TAU0 364 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM200AQ8TCP9 573 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZBTB43O43298 467 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBE3CQ15386 1083 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABI1Q8IZP0 508 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KRT222Q8N1A0 295 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNTNA6NMZ2 147 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DYNC1I1O14576 645 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CETN3O15182 167 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATP8B1O43520 1251 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TERF1P54274 439 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AP2B1P63010 937 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RGPD5Q99666 1765 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MBD5Q9P267 1494 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 WDR64B1ANS9 1081 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF131P52739 623 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MICALL1Q8N3F8 863 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HSF2BPO75031 334 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KDM4CQ9H3R0 1056 aa4.95□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UBR2Q8IWV8 1755 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PPFIA4O75335 1185 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FYB2Q5VWT5 728 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GLP2RO95838 553 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAV1Q03135 178 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SETDB1Q15047 1291 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KRT24Q2M2I5 525 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZRANB1Q9UGI0 708 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRAPPC3O43617 180 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NEK4P51957 841 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTC13Q8NBP0 860 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SIL1Q9H173 461 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ITGADQ13349 1161 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC52A2Q9HAB3 445 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCDC68Q9H2F9 335 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDE4AP27815 886 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRIN1Q05586 938 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KCTD2Q14681 263 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CENPKQ9BS16 269 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TEKT3Q9BXF9 490 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FGF19O95750 216 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPR1P16066 1061 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 APAF1O14727 1248 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MYBL2P10244 700 aa4.94□□□□□ -1.62
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PYGBP11216 843 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms