RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 COL20A1Q9P218 1284 aa22.85■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 CCDC69A6NI79 296 aa22.84■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 OPLAHO14841 1288 aa22.84■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 LIFRP42702 1097 aa22.84■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.84■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.84■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 RNF180Q86T96 592 aa22.84■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 TMTC2Q8N394 836 aa22.83■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.83■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.83■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 KCNB2Q92953 911 aa22.83■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 MAP3K14Q99558 947 aa22.83■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 PHF24Q9UPV7 400 aa22.83■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.83■■□□□ 1.25
C1orf61-220ENST00000489918 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.82■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SMPD1P17405 629 aa22.82■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SYN1P17600 705 aa22.82■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 HSPA4P34932 840 aa22.82■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 TNFAIP2Q03169 654 aa22.82■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 VTA1Q9NP79 307 aa22.82■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CPA1P15085 419 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 EDNRBP24530 442 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 DNERQ8NFT8 737 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.81■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 A0A1W2PQY0 241 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CTAGE5O15320 804 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 REC8O95072 547 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CFBP00751 764 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 KIF5BP33176 963 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 GJA9P57773 515 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 RTP1P59025 263 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 KRT32Q14532 448 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 KCNA10Q16322 511 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.8■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 PDE4DQ08499 809 aa22.79■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 MICU3Q86XE3 530 aa22.79■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 MAF1Q9H063 256 aa22.79■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.79■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 HSD17B4P51659 736 aa22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 ACLYP53396 1101 aa22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 BEX3Q00994 111 aa22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SNX17Q15036 470 aa22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 APOA5Q6Q788 366 aa22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 TLK2Q86UE8 772 aa22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.78■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CALM1P0DP23 149 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CALM2P0DP24 149 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 CALM3P0DP25 149 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 GHRHRQ02643 423 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 TRIM60Q495X7 471 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 GNASQ5JWF2 1037 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 FANCBQ8NB91 859 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 RMDN3Q96TC7 470 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 PRO3102Q9H379 93 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 SPC25Q9HBM1 224 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.77■■□□□ 1.24
C1orf61-220ENST00000489918 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 ASGR1P07306 291 aa22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 SMARCA1P28370 1054 aa22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 GNAQP50148 359 aa22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 NKX3-2P78367 333 aa22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.76■■□□□ 1.23
C1orf61-220ENST00000489918 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.7 ms