RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460330.5

PTGER3-209, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGER3, Length 1,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-209ENST00000460330 SCRN1Q12765 414 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 ME3Q16798 604 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 MAF1Q9H063 256 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 CFBP00751 764 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.23■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 CCL5P13501 91 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 GHRHRQ02643 423 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 COL20A1Q9P218 1284 aa22.22■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 CPLX1O14810 134 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 HSD17B4P51659 736 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 PKN1Q16512 942 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 NECAB1Q8N987 351 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 TRPV1Q8NER1 839 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 RNF208Q9H0X6 261 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 RPTORQ8N122 1335 aa22.2■■□□□ 1.15
PTGER3-209ENST00000460330 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.2■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 LCTP09848 1927 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 CYBAP13498 195 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 SCG2P13521 617 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ARMCX2Q7L311 632 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 GTF3C6Q969F1 213 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 STXBP3O00186 592 aa22.18■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 DTNBO60941 627 aa22.18■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 POLR2MP0CAP2 368 aa22.18■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 BARHL2Q9NY43 387 aa22.18■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ASB14A6NK59 587 aa22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 CTDNEP1O95476 244 aa22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 DNERQ8NFT8 737 aa22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 MORC4Q8TE76 937 aa22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 MEIS2O14770 477 aa22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ST18O60284 1047 aa22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 NAPAP54920 295 aa22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ST3GAL1Q11201 340 aa22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 RMDN3Q96TC7 470 aa22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.16■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 PIK3CDO00329 1044 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 CDKL5O76039 1030 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 GJB1P08034 283 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 CNGA1P29973 690 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 SOX10P56693 466 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 IL27Q8NEV9 243 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 DEFB118Q96PH6 123 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 KATNBL1Q9H079 304 aa22.15■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 POTEFA5A3E0 1075 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 EDNRBP24530 442 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ACVR2BQ13705 512 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.14■■□□□ 1.14
PTGER3-209ENST00000460330 SMCO2A6NFE2 343 aa22.14■■□□□ 1.13
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