RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP1CB-208	ENST00000455580	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP1CB-208	ENST00000455580	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PPP1CB-208	ENST00000455580	TLK2	Q86UE8	772 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP1CB-208	ENST00000455580	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP1CB-208	ENST00000455580	DNER	Q8NFT8	737 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PPP1CB-208	ENST00000455580	ABCB11	O95342	1321 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDK7	P50613	346 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	BEX3	Q00994	111 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	BAD	Q92934	168 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	KLRF2	D3W0D1	207 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIAA0355	O15063	1070 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAAP100	Q0VG06	881 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	TBC1D5	Q92609	795 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		28	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	ERICH2	A1L162	156 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	PTGS1	P23219	599 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	EDNRB	P24530	442 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	ITGB8	P26012	769 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	FBXO11	Q86XK2	927 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	SENP2	Q9HC62	589 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARVCF	O00192	962 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	PDE4D	Q08499	809 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	GPR153	Q6NV75	609 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	CHST3	Q7LGC8	479 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTMR8	Q96EF0	704 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	LTBP2	Q14767	1821 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580		B4DLN1	442 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	WTAP	Q15007	396 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZEB2	O60315	1214 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	CABYR	O75952	493 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	ANTXR2	P58335	489 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	GRM4	Q14833	912 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	SKAP1	Q86WV1	359 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	AMN	Q9BXJ7	453 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP1CB-208	ENST00000455580	RAG1	P15918	1043 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	TROAP	Q12815	778 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZBTB5	O15062	677 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	SHH	Q15465	462 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	COL20A1	Q9P218	1284 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	TBX21	Q9UL17	535 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	SCFD2	Q8WU76	684 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	MTA3	Q9BTC8	594 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	OPLAH	O14841	1288 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC27A2	O14975	620 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	TIMP1	P01033	207 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	GHRHR	Q02643	423 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	ITGA7	Q13683	1181 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	NECTIN1	Q15223	517 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	IWS1	Q96ST2	819 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	GRIN2D	O15399	1336 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	CD4	P01730	458 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	PIGS	Q96S52	555 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	RMDN3	Q96TC7	470 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CB-208	ENST00000455580	LY9	Q9HBG7	655 aa		27.9	■■■□□ 2.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms